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Catalogue de nos produits et services

- Kits d'échantillonnage ADNe -

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Constitué de :

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A associer à une pompe à membrane longue durée (pour des milieux courants) ou à une seringue (milieux stagnants).

Kit aquatique

Pour vos prélèvements marins ou d'eau douce, choisissez nos kits pour échantillonner de grands volumes d'eau de manière simple et pratique.

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1 kit = 1 échantillon

40€ HT

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Constitué de :

  • Flacon hermétique 250mL contenant des gels de silice

  • Sachet Whirl-Pak 2L

  • Paire de gants

  • Protocole d'échantillonnage

Kit terrestre

Echantillonnez vos sols et fèces grâce à nos kits adaptés pour la collecte et la conservation d'ADN terrestre.

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1 kit = 1 échantillon
8€ HT

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Constitué de :

  • Flacon hermétique 250mL contenant des gels de silice

  • Sachet Whirl-Pak 2L

  • Seringue 60mL

  • Paire de gants

  • Protocole d'échantillonnage

Kit sédiments

Collectez vos échantillons de sédiments de manière fiable et standardisée !

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1 kit = 1 échantillon
11€ HT

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Constitué de :

  • Tube 2mL contenant tampon de préservation de l'ADN

  • Ecouvillon (ou swab)

  • Paire de gants

  • Protocole d'échantillonnage

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Kit écouvillon

Analyse de régime alimentaire, détection d'espèces à enjeux... faites-parler vos échantillons environnementaux via un simple frottement swab !

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1 kit = 1 échantillon

4€ HT

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Constitué de :

  • Capteur passif (fibre de verre, lingette...)

  • Tube contenant tampon de préservation de l'ADN

  • Paire de gants

  • Protocole d'échantillonnage

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Kit capteurs passifs

Installez des capteurs passifs d'ADNe afin de collecter des informations taxonomiques sur une longue durée.

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1 kit = 1 échantillon

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Capteurs passifs CAPA_edited.jpg

- Matériel d'échantillonnage aquatique -

Conçues pour la capture d'ADNe et la filtration de grands volumes d'eau en milieu aquatique.

18€ HT / unité

 

Filtre en polyéthersulfone - jusqu'à 100L d'eau filtrée - à associer à une pompe

Capsules de filtration Waterra

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  • Surface du filtre : 300cm² ou 600cm²

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  • Diamètres de pores disponibles :

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Tampon Longmire

Constitué d'agents de stabilisation de l'ADN, ce tampon permet d'assurer une conservation optimale de vos échantillons aquatiques jusqu'à leur traitement au laboratoire.

22€ HT / unité

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Composition : H2O ; Tris-HCl ; EDTA ; NaCl ; adapté de Longmire et al. (1997)

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Volume : 50mL / capsule

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Pompe de filtration

Une pompe certifiée CE, sur batterie longue durée et rechargeable, dans une valise étanche pour réaliser vos filtrations aquatiques.

Achat : 950€ HT

Location : 100€ HT / journée d'utilisation

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Durée de fonctionnement sur batterie : 12h

Durée de recharge de la batterie : 4h

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Contrôle du volume filtré en temps réel grâce au débitmètre

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Voltmètre

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Filtration en amont : il n'est pas nécessaire de changer les tuyaux entre 2 prélèvements

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Volume filtré : une trentaine de minutes pour 30L d'eau peu turbide

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A associer à un kit tuyaux (tuyaux d'entrée et de sortie de pompe)

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Shaker

Achat : 700€ HT

Location : 100€ HT seul ou 180€ HT avec une pompe / journée d'utilisation

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Durée de fonctionnement sur batterie : 2h

Durée de recharge de la batterie : 1h

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Portable et sur batterie, le shaker est conçu pour agiter le tampon Longmire à l'intérieur de la capsule et favorise la resuspension de l'ADN.

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Quad-holder

Achat : 400€ HT

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Réalisez simultanément jusqu'à 4 prélèvements aquatiques grâce à cet adaptateur permettant d'optimiser le temps d'échantillonnage.

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4 capsules nécessitent 4 pompes

Perche télescopique

Achat : 100€ HT

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Facilitez votre échantillonnage aquatique en associant les capsules et/ou le quad-holder à une perche.

Perche télescopique

- Formations ADNe -

En visioconférence (gratuit) ou sur le terrain

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Discussion autour de votre problématique et de la stratégie d'échantillonnage 

Utilisation du matériel, bonnes pratiques, minimisation des contaminations... une formation personnalisée en amont de vos prélèvements aquatiques et terrestres !

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Formation échantillonnage

En visioconférence ou dans nos locaux

Formation ADNe

Phase laboratoire, pipeline bioinformatique, résultats attendus... nous vous expliquons tous les éléments derrière une analyse ADNe.

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En visioconférence ou dans nos locaux

  • Formation individuelle : 1200€/jour

  • Formation collective (minimum 3 stagiaires) : 400€/jour

Formation bioinformatique

Apprenez à analyser un jeu de données de séquençage NGS pour obtenir la liste des MOTUs et des taxons.

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- Analyses ADNe -

  • Matrices de départ : filtration d'eau, sol, sédiments, contenus stomacaux, fèces, écouvillons, miel, pollen, mouches, fleurs, etc.

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  • Des protocoles conçus pour éviter toute contamination

Extraction d'ADN

Nous réalisons vos extractions d'ADN intra et extracellulaire dans un laboratoire dédié à la manipulation d'échantillons environnementaux.

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  • Matrices de départ : extraits ADN, eau, sol, sédiments, contenus stomacaux, fèces, écouvillons, miel, pollen, mouches, fleurs, etc. 

  • Groupes taxonomiques ciblés : bactéries, animaux, plantes, insectes, poissons, mammifères, etc.

  • Une méthodologie transparente et des résultats fiables

Inventaire metabarcoding

A partir de vos prélèvements environnementaux, nous dressons des inventaires de biodiversité aquatique et terrestre.

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  • Matrices de départ : extraits ADN, eau, sol, sédiments, contenus stomacaux, fèces, swabs, miel, pollen, mouches, fleurs, etc.

  • Espèces détectées : requins, raies, crapauds, tritons, silures, vipères, algues...

  • Méthodologie qPCR transparente et résultats fiables

Détection d'espèces

Traquez de manière non invasive vos espèces d'intérêt (menacées, envahissantes, etc.). 

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  • Pipeline bioinformatique développé pour des données metabarcoding ADNe

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  • Livrables clairs et vulgarisés

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  • Méthodologies transparentes

Analyse bioinformatique

Confiez-nous l'analyse de vos données de séquençage NGS pour obtenir la liste des taxons identifiés.

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  • Analyses statistiques robustes

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  • Indices de diversité

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  • Livrables clairs et vulgarisés

Analyse écologique

Grâce à des analyses statistiques et des données de terrain, nous faisons parler vos données ADNe pour obtenir des informations écologiques.

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- Développement -

Marqueur metabarcoding

Vous souhaitez inventorier un groupe taxonomique dont les amorces ne sont pas encore connues ? Nous développons un marqueur adapté à votre projet.

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  • Design de novo in silico & test in vitro / in situ

  • Optimisation à partir d'amorces publiées & test in vitro / in situ

  • Design d'amorces de novo in silico & test in vitro sur vos échantillons de tissus

  • Optimisation à partir d'amorces publiées & test in vitro / in situ

Marqueur qPCR

Vous souhaitez détecter une espèce dont les amorces ne sont pas encore connues ? Nous développons un marqueur spécifique adapté à votre problématique.

  • Design amorces et sonde de novo in silico & test in vitro sur vos échantillons de tissus

  • Optimisation à partir d'amorces et sonde publiées & test in vitro / in situ

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Amorce de blocage

Afin de bloquer l'amplification d'une espèce non-cible, nous développons une amorce spécifique de blocage.

  • Design d'amorce & test in vitro 

  • Exemple : éviter d'amplifier l'espèce hôte pour une analyse de régime alimentaire

Base de référence

Nous établissons votre base de référence à partir d'échantillons de tissus afin d'optimiser la résolution de vos futurs inventaires ADNe.

  • Design de novo in silico & test in vitro / in situ

  • Optimisation à partir d'amorces publiées & test in vitro / in situ

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