Les livrables fournis par ARGALY sont : * Un rapport d'analyses décrivant les différentes phases du projet (méthodologies, résultats) * Un tableau de contingence listant les taxons identifiés et le nombre de séquences associées pour chaque échantillon * Un rapport d'analyses statistiques et/ou écologiques si l'étude le demande

Nous fournissons un devis adapté à chaque nouvelle demande d’étude, car le tarif est dégressif en fonction du nombre d'échantillons. A titre indicatif, voici quelques exemples de tarifs généraux : * Analyse de diversité des poissons (20 filtrations aquatiques) : 270€ / échantillon. * Analyse de biodiversité globale (eucaryotes & bactéries, 20 échantillons de sol) : 300€ / échantillon. * Analyse de détection d’espèce par qPCR (20 échantillons) : 190€ / échantillon.

Nous fournissons les livrables d'une étude ADNe sous 2-3 mois après réception des échantillons.

Analyse peu coûteuse et résultats rapides Fiabilité de détection accrue par rapport aux méthodes traditionnelles d'inventaire Protocole de prélèvement simple Pas besoin d'expertise taxonomique sur le terrain Recensement de plusieurs groupes taxonomiques en une seule analyse

Pas d'informations sur les individus (âge, sexe, stade de développement...) et les tailles de populations Information semi-quantitative (pour le moment...) Résolution taxonomique dépendante des bases de références et des amorces Biais issus de la PCR et du séquençage (erreurs, amplifications préferentielles...)

Le metabarcoding permet d'obtenir des résultats semi-quantitatifs, c'est-à-dire que les nombres de séquences identifiées pour chaque taxon sont comparables seulement au sein d'un même échantillon. Pour comparer les échantillons analysés, l'abondance relative des taxons peut être représentée.

Si vos échantillons correspondent à de l'ADN déjà extrait, merci de nous envoyer un volume minimum de 50µL par échantillon afin de procéder à toutes les étapes d'analyse.

Notre matériel de prélèvement n'est pas certifié "DNA-free" mais il est produit et préparé aussi stérilement que possible, en évitant au maximum toute contamination externe. Les contaminations peuvent être examinées via l'analyse de "blancs terrain", par exemple une filtration d'eau minérale sur le terrain pour des prélèvements aquatiques ou un flacon vide laissé ouvert durant l'échantillonnage pour des prélèvements de sol.

Contactez Céline Modugno à l'adresse suivante : celine.modugno@argaly.com ou par téléphone au +33748121252.

Oui, nous faisons livrer notre matériel à l'international. Les batteries des pompes et des shakers peuvent toutefois être soumises à restriction pour des envois par avion.

En effet, certaines parties de la pompe de filtration peuvent se corroder suite à l'exposition prolongée à un environnement salé. Il est recommandé de stocker le matériel de filtration hors des bateaux lorsque les prélèvements ont été effectués.

La pompe peut être utilisée environ 12 heures avant d'être rechargée.

Compter environ 4h pour recharger entièrement la batterie de la pompe.

La persistance de l'ADN environnemental dépend des conditions climatiques et physicochimiques. En milieu aquatique, l'ADN peut persister entre quelques jours et plusieurs semaines. En milieu terrestre, l'ADN persiste entre quelques semaines et quelques mois, et même, en conditions favorables, plusieurs années voire dizaines années à l'état de traces !

L'ADN environnemental peut être transporté de manière passive ou active (dépôt, percolation, courant, dissémination, déplacement d'organismes vivants...). En milieu aquatique, l'ADNe peut être détecté entre plusieurs mètres et quelques kilomètres depuis son origine. Le transport de l'ADNe en milieu terrestre est généralement limité à quelques mètres ou dizaines de mètres au plus autour de sa source.

Un protocole d'échantillonnage optimal pour une analyse ADNe dépend du type d'organisme ciblé, de la question scientifique posée (s'agit-il d'estimer la biodiversité globale, de détecter des espèces en particulier...) ainsi que de contraintes statistiques, logistiques et financières. Idéalement, une stratégie d'échantillonnage maximise le signal biologique tout en minimisant l'effort d'échantillonnage. Les échantillons collectés doivent être les plus représentatifs possible de l'écosystème étudié : ceci implique la détermination préalable des différents habitats en place et la réalisation de réplicats biologiques. De plus, l'étendue de la zone à échantillonner ainsi que la résolution d'échantillonnage sont des paramètres importants à prendre en compte. L'échantillonnage peut être systématique, lorsqu'il existe des gradients environnementaux ou que l'objectif est d'analyser l'influence des distances, ou bien aléatoire. Dans le cas d'un environnement hétérogène, la discrétisation en unités et un échantillonnage stratifié peuvent permettre d'augmenter la représentativité des échantillons collectés. Toutes les unités échantillonnées doivent être collectées dans des conditions standardisées pour être comparables. Pour déterminer l'ensemble de ces paramètres, une étude pilote peut être conduite en amont.