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Foire aux questions
Généralités
Matériel
Stratégie d'analyse
Les livrables fournis par ARGALY sont :
* Un rapport d'analyses décrivant les différentes phases du projet (méthodologies, résultats)
* Un tableau de contingence listant les taxons identifiés et le nombre de séquences associées pour chaque échantillon
* Un rapport d'analyses statistiques et/ou écologiques si l'étude le demande
Nous fournissons un devis adapté à chaque nouvelle demande d’étude, car le tarif est dégressif en fonction du nombre d'échantillons.
A titre indicatif, voici quelques exemples de tarifs généraux :
* Analyse de diversité des poissons (20 filtrations aquatiques) : 270€ / échantillon.
* Analyse de biodiversité globale (eucaryotes & bactéries, 20 échantillons de sol) : 300€ / échantillon.
* Analyse de détection d’espèce par qPCR (20 échantillons) : 190€ / échantillon.
Nous fournissons les livrables d'une étude ADNe sous 2-3 mois après réception des échantillons.
1. Analyse peu coûteuse et résultats rapides
2. Fiabilité de détection accrue par rapport aux méthodes traditionnelles d'inventaire
3. Protocole de prélèvement simple
4. Pas besoin d'expertise taxonomique sur le terrain
5. Recensement de plusieurs groupes taxonomiques en une seule analyse
1. Pas d'informations sur les individus (âge, sexe, stade de développement...) et les tailles de populations
2. Information semi-quantitative (pour le moment...)
3. Résolution taxonomique dépendante des bases de références et des amorces
4. Biais issus de la PCR et du séquençage (erreurs, amplifications préferentielles...)
Le metabarcoding permet d'obtenir des résultats semi-quantitatifs, c'est-à-dire que les nombres de séquences identifiées pour chaque taxon sont comparables seulement au sein d'un même échantillon. Pour comparer les échantillons analysés, l'abondance relative des taxons peut être représentée.
Si vos échantillons correspondent à de l'ADN déjà extrait, merci de nous envoyer un volume minimum de 50µL par échantillon afin de procéder à toutes les étapes d'analyse.
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